年度归档: 2025 年

3 篇文章

驱动不同物种突变率差异的隐秘力量
转载自https://mp.weixin.qq.com/s/lRePO9U2c8rbsbXw4OUzWg 点击蓝字,关注我们 改变种群基因频率的力量是生物演化背后的驱动机制。有四种“演化力量”可以引起种群等位基因频率发生变化,包括突变、基因流、遗传漂变和自然选择。突变会导致生物基因组中核苷酸序列发生变化并产生新的基因型,为其它演化力量发挥作用提供了…
基于图形泛基因组的群体GWAS实操代码《四》:基于图泛基因组的变异鉴定
引言 同一物种的基因组通常包含核心保守组分,以及个体或群体间存在差异的遗传物质集合——即“泛基因组(pangenome)”,简单的线性泛基因组(linear pan-genome)无法直观地描述同一物种个体基因组之间的变异,因此发展了基于图的泛基因组(graph-based pan-genome),图泛基因组以节点和路径的形式存储序列和结构变异信息…
重测序与群体遗传之软件安装&数据准备
转载自微信公众号 数信院 原文链接 https://mp.weixin.qq.com/s/drzZIm5sXQh058t42I03UA 重测序 核心概念: 重测序是指对一个已知参考基因组的物种的多个个体进行基因组测序。 它的目标不是从头组装一个全新的基因组,而是将测序得到的短序列片段(reads)比对(Align) 到已有的高质量参考基因组上。 通…
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