vcftools批量计算不同群体等位基因频率(非maf次等位基因频率),并合并成一个文件 Vensin | 2024-8-09 16:21 | 658 | 数据分析 388 字 | 7 分钟 STEP1 主要使用到的代码分两部分,第一步脚本为shell脚本:Population_freq.sh ,可计算不同群体的等位基因频率,并生成单独文件。 需要准备的文件有两个,vcf文件以及群体分群文件 vcf_file="186_filtered.LD.pruned.noContig.recode.vcf"pop_file="186sample.… Linuxpythonshell